Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEFHP12036 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEFHP12036 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms