Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM10L2BP0DMW5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms