Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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