Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COCHO43405 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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