Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CEP290O15078 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CEP290O15078 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CEP290O15078 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CEP290O15078 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CEP290O15078 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP290O15078 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP290O15078 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP290O15078 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CEP290O15078 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CEP290O15078 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP290O15078 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP290O15078 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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