Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNMO15061 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNMO15061 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNMO15061 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms