Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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