Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms