Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms