Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms