Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms