Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms