Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHKBQ9Y259 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms