Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAK1Q9UPV9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms