Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms