Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms