Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms