Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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COPS7AQ9UBW8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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COPS7AQ9UBW8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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