Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DBF4Q9UBU7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DBF4Q9UBU7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DBF4Q9UBU7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DBF4Q9UBU7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DBF4Q9UBU7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DBF4Q9UBU7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DBF4Q9UBU7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms