Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCOR3Q9P2K3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms