Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC180Q9P1Z9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms