Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCHIP1Q9P0W5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms