Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms