Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC10Q9NYD6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC10Q9NYD6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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