Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms