Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms