Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPHK2Q9NRA0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms