Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLXNA4Q9HCM2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms