Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NRDE2Q9H7Z3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms