Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms