Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF6Q9BYE7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms