Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms