Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPKQ9BS16 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms