Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF1Q9BQI6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms