Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms