Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms