Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms