Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MVB12AQ96EY5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms