Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CAVIN3Q969G5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CAVIN3Q969G5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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CAVIN3Q969G5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CAVIN3Q969G5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CAVIN3Q969G5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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