Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms