Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms