Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CSNK2A3Q8NEV1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CSNK2A3Q8NEV1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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