Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF248Q8NDW4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF248Q8NDW4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF248Q8NDW4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF248Q8NDW4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF248Q8NDW4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF248Q8NDW4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF248Q8NDW4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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