Protein–RNA interactions for Protein: Q8N945

PRELID2, PRELI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2Q8N945 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID2Q8N945 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms