Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms