Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms