Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms