Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms