Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms