Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC93Q567U6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms